Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC126Q96EE4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC126Q96EE4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms