Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TM9SF4Q92544 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF4Q92544 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms