Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMV7

LEKR1, Leucine-, glutamate- and lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEKR1Q6ZMV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LEKR1Q6ZMV7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LEKR1Q6ZMV7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LEKR1Q6ZMV7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LEKR1Q6ZMV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms