Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN9

PSRC1, Proline/serine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSRC1Q6PGN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PSRC1Q6PGN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSRC1Q6PGN9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSRC1Q6PGN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSRC1Q6PGN9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSRC1Q6PGN9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSRC1Q6PGN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSRC1Q6PGN9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms