Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUSP28Q4G0W2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DUSP28Q4G0W2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DUSP28Q4G0W2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms