Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP221Q4G0U5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP221Q4G0U5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP221Q4G0U5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms