Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFRLQ15198 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRLQ15198 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDGFRLQ15198 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRLQ15198 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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