Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
GAPVD1Q14C86 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
GAPVD1Q14C86 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
GAPVD1Q14C86 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
GAPVD1Q14C86 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC39.59■■■■□ 3.93
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