Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TWF1Q12792 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TWF1Q12792 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWF1Q12792 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWF1Q12792 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms