Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TWF1Q12792 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TWF1Q12792 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TWF1Q12792 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TWF1Q12792 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TWF1Q12792 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TWF1Q12792 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TWF1Q12792 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TWF1Q12792 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TWF1Q12792 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TWF1Q12792 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TWF1Q12792 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TWF1Q12792 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TWF1Q12792 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TWF1Q12792 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TWF1Q12792 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TWF1Q12792 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TWF1Q12792 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TWF1Q12792 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TWF1Q12792 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TWF1Q12792 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TWF1Q12792 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TWF1Q12792 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TWF1Q12792 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TWF1Q12792 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TWF1Q12792 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TWF1Q12792 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TWF1Q12792 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TWF1Q12792 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TWF1Q12792 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TWF1Q12792 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TWF1Q12792 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TWF1Q12792 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TWF1Q12792 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TWF1Q12792 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TWF1Q12792 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TWF1Q12792 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TWF1Q12792 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TWF1Q12792 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TWF1Q12792 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TWF1Q12792 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TWF1Q12792 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TWF1Q12792 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TWF1Q12792 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TWF1Q12792 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TWF1Q12792 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TWF1Q12792 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TWF1Q12792 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TWF1Q12792 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
TWF1Q12792 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TWF1Q12792 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWF1Q12792 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TWF1Q12792 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TWF1Q12792 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TWF1Q12792 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TWF1Q12792 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWF1Q12792 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWF1Q12792 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TWF1Q12792 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TWF1Q12792 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TWF1Q12792 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TWF1Q12792 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TWF1Q12792 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TWF1Q12792 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TWF1Q12792 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TWF1Q12792 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TWF1Q12792 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TWF1Q12792 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TWF1Q12792 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TWF1Q12792 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TWF1Q12792 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TWF1Q12792 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TWF1Q12792 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TWF1Q12792 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TWF1Q12792 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TWF1Q12792 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TWF1Q12792 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TWF1Q12792 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TWF1Q12792 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TWF1Q12792 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TWF1Q12792 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TWF1Q12792 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TWF1Q12792 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TWF1Q12792 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TWF1Q12792 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TWF1Q12792 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TWF1Q12792 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWF1Q12792 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TWF1Q12792 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TWF1Q12792 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TWF1Q12792 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TWF1Q12792 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TWF1Q12792 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TWF1Q12792 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TWF1Q12792 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TWF1Q12792 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TWF1Q12792 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TWF1Q12792 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TWF1Q12792 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TWF1Q12792 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
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