Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PMP22Q01453 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PMP22Q01453 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMP22Q01453 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMP22Q01453 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms