Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRCDQ00LT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRCDQ00LT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms