Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BACE1P56817 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BACE1P56817 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BACE1P56817 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BACE1P56817 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BACE1P56817 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BACE1P56817 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BACE1P56817 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BACE1P56817 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BACE1P56817 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BACE1P56817 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BACE1P56817 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BACE1P56817 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BACE1P56817 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BACE1P56817 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BACE1P56817 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BACE1P56817 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BACE1P56817 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BACE1P56817 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BACE1P56817 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BACE1P56817 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BACE1P56817 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BACE1P56817 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BACE1P56817 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BACE1P56817 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BACE1P56817 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BACE1P56817 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BACE1P56817 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BACE1P56817 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BACE1P56817 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BACE1P56817 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BACE1P56817 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BACE1P56817 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BACE1P56817 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BACE1P56817 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BACE1P56817 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BACE1P56817 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BACE1P56817 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BACE1P56817 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BACE1P56817 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BACE1P56817 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BACE1P56817 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BACE1P56817 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BACE1P56817 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BACE1P56817 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BACE1P56817 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BACE1P56817 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BACE1P56817 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BACE1P56817 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BACE1P56817 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BACE1P56817 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BACE1P56817 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BACE1P56817 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BACE1P56817 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BACE1P56817 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BACE1P56817 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BACE1P56817 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BACE1P56817 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BACE1P56817 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BACE1P56817 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BACE1P56817 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BACE1P56817 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms