Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSEN2P49810 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSEN2P49810 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSEN2P49810 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms