Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPIAP49247 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPIAP49247 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPIAP49247 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPIAP49247 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPIAP49247 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPIAP49247 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPIAP49247 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPIAP49247 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPIAP49247 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPIAP49247 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPIAP49247 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPIAP49247 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPIAP49247 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPIAP49247 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPIAP49247 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPIAP49247 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPIAP49247 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPIAP49247 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPIAP49247 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPIAP49247 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPIAP49247 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPIAP49247 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPIAP49247 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPIAP49247 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPIAP49247 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPIAP49247 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPIAP49247 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPIAP49247 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPIAP49247 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPIAP49247 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPIAP49247 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPIAP49247 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPIAP49247 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPIAP49247 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPIAP49247 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPIAP49247 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPIAP49247 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPIAP49247 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPIAP49247 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPIAP49247 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPIAP49247 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPIAP49247 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPIAP49247 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPIAP49247 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPIAP49247 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPIAP49247 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPIAP49247 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPIAP49247 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPIAP49247 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPIAP49247 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPIAP49247 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms