Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD97P48960 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD97P48960 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD97P48960 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD97P48960 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD97P48960 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD97P48960 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD97P48960 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD97P48960 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD97P48960 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD97P48960 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD97P48960 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD97P48960 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD97P48960 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD97P48960 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD97P48960 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD97P48960 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD97P48960 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD97P48960 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD97P48960 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD97P48960 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD97P48960 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD97P48960 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD97P48960 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD97P48960 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD97P48960 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD97P48960 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD97P48960 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD97P48960 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD97P48960 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD97P48960 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD97P48960 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD97P48960 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD97P48960 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD97P48960 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD97P48960 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD97P48960 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD97P48960 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD97P48960 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD97P48960 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD97P48960 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD97P48960 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD97P48960 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms