Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC13P31276 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC13P31276 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms