Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD38P28907 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD38P28907 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD38P28907 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD38P28907 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD38P28907 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD38P28907 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD38P28907 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CD38P28907 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD38P28907 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD38P28907 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD38P28907 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD38P28907 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD38P28907 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD38P28907 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD38P28907 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD38P28907 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD38P28907 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD38P28907 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD38P28907 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD38P28907 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD38P28907 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD38P28907 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD38P28907 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD38P28907 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD38P28907 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD38P28907 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD38P28907 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD38P28907 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD38P28907 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD38P28907 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD38P28907 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD38P28907 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD38P28907 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD38P28907 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD38P28907 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD38P28907 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD38P28907 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD38P28907 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD38P28907 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD38P28907 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD38P28907 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD38P28907 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD38P28907 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD38P28907 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD38P28907 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD38P28907 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD38P28907 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD38P28907 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD38P28907 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD38P28907 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD38P28907 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD38P28907 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD38P28907 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD38P28907 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD38P28907 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD38P28907 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD38P28907 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms