Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD247P20963 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD247P20963 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD247P20963 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD247P20963 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD247P20963 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD247P20963 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD247P20963 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD247P20963 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD247P20963 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD247P20963 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD247P20963 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD247P20963 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD247P20963 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD247P20963 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD247P20963 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD247P20963 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD247P20963 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD247P20963 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD247P20963 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD247P20963 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD247P20963 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD247P20963 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD247P20963 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD247P20963 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD247P20963 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD247P20963 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD247P20963 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD247P20963 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD247P20963 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD247P20963 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD247P20963 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD247P20963 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD247P20963 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD247P20963 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD247P20963 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD247P20963 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD247P20963 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD247P20963 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD247P20963 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD247P20963 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD247P20963 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD247P20963 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD247P20963 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD247P20963 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD247P20963 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD247P20963 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD247P20963 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD247P20963 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD247P20963 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD247P20963 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD247P20963 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD247P20963 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD247P20963 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD247P20963 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD247P20963 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD247P20963 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms