Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GM2AP17900 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GM2AP17900 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GM2AP17900 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GM2AP17900 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GM2AP17900 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GM2AP17900 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GM2AP17900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GM2AP17900 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GM2AP17900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GM2AP17900 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GM2AP17900 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GM2AP17900 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GM2AP17900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GM2AP17900 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GM2AP17900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GM2AP17900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GM2AP17900 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GM2AP17900 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GM2AP17900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GM2AP17900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GM2AP17900 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GM2AP17900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GM2AP17900 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GM2AP17900 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GM2AP17900 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GM2AP17900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GM2AP17900 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GM2AP17900 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GM2AP17900 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GM2AP17900 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GM2AP17900 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GM2AP17900 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GM2AP17900 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GM2AP17900 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GM2AP17900 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GM2AP17900 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GM2AP17900 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GM2AP17900 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GM2AP17900 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GM2AP17900 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GM2AP17900 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GM2AP17900 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GM2AP17900 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GM2AP17900 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GM2AP17900 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GM2AP17900 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GM2AP17900 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GM2AP17900 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GM2AP17900 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GM2AP17900 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GM2AP17900 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GM2AP17900 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GM2AP17900 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GM2AP17900 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms