Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA1P17302 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA1P17302 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA1P17302 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA1P17302 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA1P17302 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA1P17302 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA1P17302 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA1P17302 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA1P17302 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA1P17302 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA1P17302 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA1P17302 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA1P17302 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA1P17302 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA1P17302 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA1P17302 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA1P17302 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA1P17302 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA1P17302 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA1P17302 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA1P17302 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA1P17302 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA1P17302 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA1P17302 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA1P17302 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA1P17302 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA1P17302 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA1P17302 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA1P17302 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA1P17302 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA1P17302 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA1P17302 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJA1P17302 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA1P17302 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA1P17302 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA1P17302 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJA1P17302 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJA1P17302 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA1P17302 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA1P17302 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA1P17302 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA1P17302 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA1P17302 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA1P17302 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJA1P17302 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA1P17302 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA1P17302 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA1P17302 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA1P17302 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA1P17302 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJA1P17302 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA1P17302 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA1P17302 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA1P17302 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA1P17302 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA1P17302 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA1P17302 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA1P17302 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA1P17302 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA1P17302 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA1P17302 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA1P17302 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA1P17302 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms