Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSP16219 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSP16219 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSP16219 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSP16219 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSP16219 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSP16219 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSP16219 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSP16219 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSP16219 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSP16219 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSP16219 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACADSP16219 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSP16219 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSP16219 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSP16219 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSP16219 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSP16219 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACADSP16219 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSP16219 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSP16219 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSP16219 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSP16219 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSP16219 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACADSP16219 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSP16219 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSP16219 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSP16219 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSP16219 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSP16219 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSP16219 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACADSP16219 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSP16219 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSP16219 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSP16219 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSP16219 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSP16219 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSP16219 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACADSP16219 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACADSP16219 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACADSP16219 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACADSP16219 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACADSP16219 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSP16219 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSP16219 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSP16219 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACADSP16219 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACADSP16219 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSP16219 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSP16219 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSP16219 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSP16219 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSP16219 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACADSP16219 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACADSP16219 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSP16219 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSP16219 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSP16219 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSP16219 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACADSP16219 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSP16219 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSP16219 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSP16219 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSP16219 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSP16219 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSP16219 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACADSP16219 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ACADSP16219 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACADSP16219 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSP16219 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSP16219 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSP16219 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSP16219 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms