Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL6A2P12110 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL6A2P12110 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms