Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD3P0DMS9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD3P0DMS9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms