Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
POLA1P09884 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
POLA1P09884 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
POLA1P09884 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
POLA1P09884 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
POLA1P09884 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
POLA1P09884 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
POLA1P09884 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
POLA1P09884 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
POLA1P09884 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
POLA1P09884 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
POLA1P09884 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
POLA1P09884 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
POLA1P09884 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
POLA1P09884 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
POLA1P09884 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
POLA1P09884 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
POLA1P09884 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
POLA1P09884 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
POLA1P09884 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
POLA1P09884 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
POLA1P09884 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
POLA1P09884 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
POLA1P09884 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
POLA1P09884 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
POLA1P09884 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
POLA1P09884 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
POLA1P09884 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLA1P09884 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLA1P09884 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLA1P09884 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLA1P09884 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLA1P09884 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
POLA1P09884 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
POLA1P09884 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
POLA1P09884 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
POLA1P09884 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
POLA1P09884 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
POLA1P09884 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
POLA1P09884 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
POLA1P09884 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
POLA1P09884 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
POLA1P09884 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
POLA1P09884 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
POLA1P09884 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
POLA1P09884 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
POLA1P09884 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
POLA1P09884 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
POLA1P09884 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
POLA1P09884 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
POLA1P09884 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
POLA1P09884 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
POLA1P09884 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
POLA1P09884 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
POLA1P09884 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
POLA1P09884 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
POLA1P09884 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
POLA1P09884 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
POLA1P09884 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
POLA1P09884 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
POLA1P09884 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
POLA1P09884 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
POLA1P09884 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
POLA1P09884 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
POLA1P09884 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
POLA1P09884 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
POLA1P09884 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
POLA1P09884 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
POLA1P09884 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
POLA1P09884 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
POLA1P09884 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
POLA1P09884 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
POLA1P09884 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
POLA1P09884 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
POLA1P09884 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
POLA1P09884 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
POLA1P09884 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
POLA1P09884 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC40.22■■■■■ 4.03
POLA1P09884 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
POLA1P09884 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
POLA1P09884 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
POLA1P09884 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
POLA1P09884 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
POLA1P09884 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
POLA1P09884 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
POLA1P09884 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms