Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLSTN1O94985 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN1O94985 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSTN1O94985 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms