Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT3O75175 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT3O75175 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT3O75175 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms