Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC154A6NI56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC154A6NI56 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC154A6NI56 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms