Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM247A6NEH6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM247A6NEH6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms