Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTN1Q12860 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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