Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPHK2Q9NRA0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPHK2Q9NRA0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms