Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC9Q96Q05 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms