Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNAJA4Q8WW22 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms