Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NWD1Q149M9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NWD1Q149M9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
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