Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHA3P29320 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHA3P29320 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms