Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTA3Q9BTC8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms