Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms