RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294742.6

ARPC5-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC5, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5-201ENST00000294742 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.35■■■■□ 3.89
ARPC5-201ENST00000294742 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.64■■■■□ 3.14
ARPC5-201ENST00000294742 ABCC9O60706 1549 aa33.35■■■□□ 2.93
ARPC5-201ENST00000294742 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
ARPC5-201ENST00000294742 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.6■■■□□ 2.81
ARPC5-201ENST00000294742 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.55■■■□□ 2.8
ARPC5-201ENST00000294742 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.44■■■□□ 2.78
ARPC5-201ENST00000294742 NACADO15069 1562 aa32.43■■■□□ 2.78
ARPC5-201ENST00000294742 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.3■■■□□ 2.76
ARPC5-201ENST00000294742 SCRIBQ14160 1630 aa31.72■■■□□ 2.67
ARPC5-201ENST00000294742 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.62■■■□□ 2.65
ARPC5-201ENST00000294742 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.53■■■□□ 2.64
ARPC5-201ENST00000294742 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.37■■■□□ 2.61
ARPC5-201ENST00000294742 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
ARPC5-201ENST00000294742 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.62■■■□□ 2.49
ARPC5-201ENST00000294742 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
ARPC5-201ENST00000294742 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
ARPC5-201ENST00000294742 SMARCA4P51532 1647 aa30.39■■■□□ 2.46
ARPC5-201ENST00000294742 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.36■■■□□ 2.45
ARPC5-201ENST00000294742 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
ARPC5-201ENST00000294742 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.18■■■□□ 2.42
ARPC5-201ENST00000294742 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.08■■■□□ 2.41
ARPC5-201ENST00000294742 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.07■■■□□ 2.4
ARPC5-201ENST00000294742 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.07■■■□□ 2.4
ARPC5-201ENST00000294742 WIZO95785 1651 aa30.07■■■□□ 2.4
ARPC5-201ENST00000294742 SMARCA2P51531 1590 aa30.02■■■□□ 2.4
ARPC5-201ENST00000294742 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ARPC5-201ENST00000294742 NCAPD3P42695 1498 aa29.94■■■□□ 2.38
ARPC5-201ENST00000294742 HMGXB3Q12766 1538 aa29.84■■■□□ 2.37
ARPC5-201ENST00000294742 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ARPC5-201ENST00000294742 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
ARPC5-201ENST00000294742 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.42■■■□□ 2.3
ARPC5-201ENST00000294742 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.11■■■□□ 2.25
ARPC5-201ENST00000294742 CFTRP13569 1480 aa29.08■■■□□ 2.25
ARPC5-201ENST00000294742 NESP48681 1621 aa29.07■■■□□ 2.24
ARPC5-201ENST00000294742 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.03■■■□□ 2.24
ARPC5-201ENST00000294742 PRDM2Q13029 1718 aa28.87■■■□□ 2.21
ARPC5-201ENST00000294742 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.8■■■□□ 2.2
ARPC5-201ENST00000294742 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.78■■■□□ 2.2
ARPC5-201ENST00000294742 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.72■■■□□ 2.19
ARPC5-201ENST00000294742 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.66■■■□□ 2.18
ARPC5-201ENST00000294742 ERCC6Q03468 1493 aa28.65■■■□□ 2.18
ARPC5-201ENST00000294742 ABCC8Q09428 1581 aa28.57■■■□□ 2.16
ARPC5-201ENST00000294742 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.49■■■□□ 2.15
ARPC5-201ENST00000294742 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
ARPC5-201ENST00000294742 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ARPC5-201ENST00000294742 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
ARPC5-201ENST00000294742 CUX1P39880 1505 aa28.44■■■□□ 2.14
ARPC5-201ENST00000294742 SYNJ1O43426 1573 aa28.4■■■□□ 2.14
ARPC5-201ENST00000294742 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.4■■■□□ 2.14
ARPC5-201ENST00000294742 TOPBP1Q92547 1522 aa28.39■■■□□ 2.14
ARPC5-201ENST00000294742 WDR62O43379 1518 aa28.38■■■□□ 2.13
ARPC5-201ENST00000294742 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.35■■■□□ 2.13
ARPC5-201ENST00000294742 TOP2BQ02880 1626 aa28.34■■■□□ 2.13
ARPC5-201ENST00000294742 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.32■■■□□ 2.12
ARPC5-201ENST00000294742 TRIM41Q8WV44 630 aa28.23■■■□□ 2.11
ARPC5-201ENST00000294742 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.23■■■□□ 2.11
ARPC5-201ENST00000294742 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
ARPC5-201ENST00000294742 CUX2O14529 1486 aa28.14■■■□□ 2.1
ARPC5-201ENST00000294742 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.09■■■□□ 2.09
ARPC5-201ENST00000294742 SOGA1O94964 1423 aa28.07■■■□□ 2.08
ARPC5-201ENST00000294742 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
ARPC5-201ENST00000294742 IFT140Q96RY7 1462 aa28.02■■■□□ 2.08
ARPC5-201ENST00000294742 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.98■■■□□ 2.07
ARPC5-201ENST00000294742 WDR97A6NE52 1622 aa27.96■■■□□ 2.07
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
ARPC5-201ENST00000294742 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
ARPC5-201ENST00000294742 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.83■■■□□ 2.05
ARPC5-201ENST00000294742 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.041e-6■■■□□ 17.5
ARPC5-201ENST00000294742 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.81■■■□□ 2.04
ARPC5-201ENST00000294742 KIF27Q86VH2 1401 aa27.8■■■□□ 2.04
ARPC5-201ENST00000294742 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
ARPC5-201ENST00000294742 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.77■■■□□ 2.04
ARPC5-201ENST00000294742 EEA1Q15075 1411 aa27.68■■■□□ 2.02
ARPC5-201ENST00000294742 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
ARPC5-201ENST00000294742 PBRM1Q86U86 1689 aa27.66■■■□□ 2.02
ARPC5-201ENST00000294742 GRIN2BQ13224 1484 aa27.66■■■□□ 2.02
ARPC5-201ENST00000294742 IGF1RP08069 1367 aa27.65■■■□□ 2.02
ARPC5-201ENST00000294742 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.64■■■□□ 2.01
ARPC5-201ENST00000294742 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.58■■■□□ 2.01
ARPC5-201ENST00000294742 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.57■■■□□ 2
ARPC5-201ENST00000294742 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
ARPC5-201ENST00000294742 ADAMTS12P58397 1594 aa27.5■■□□□ 1.99
ARPC5-201ENST00000294742 CUL7Q14999 1698 aa27.49■■□□□ 1.99
ARPC5-201ENST00000294742 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.48■■□□□ 1.99
ARPC5-201ENST00000294742 PRXQ9BXM0 1461 aa27.48■■□□□ 1.99
ARPC5-201ENST00000294742 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.46■■□□□ 1.99
ARPC5-201ENST00000294742 SYNJ2O15056 1496 aa27.41■■□□□ 1.98
ARPC5-201ENST00000294742 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.39■■□□□ 1.97
ARPC5-201ENST00000294742 KIF21BO75037 1637 aa27.38■■□□□ 1.97
ARPC5-201ENST00000294742 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ARPC5-201ENST00000294742 FBLN2P98095 1184 aa27.33■■□□□ 1.97
ARPC5-201ENST00000294742 GRIN2AQ12879 1464 aa27.33■■□□□ 1.96
ARPC5-201ENST00000294742 CHD1O14646 1710 aa27.31■■□□□ 1.96
ARPC5-201ENST00000294742 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.29■■□□□ 1.96
ARPC5-201ENST00000294742 GOLGA3Q08378 1498 aa27.26■■□□□ 1.96
ARPC5-201ENST00000294742 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.21■■□□□ 1.95
ARPC5-201ENST00000294742 CEP170Q5SW79 1584 aa27.19■■□□□ 1.94
ARPC5-201ENST00000294742 NUP160Q12769 1436 aa27.18■■□□□ 1.94
ARPC5-201ENST00000294742 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms