Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms