Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms