Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XBP1P17861 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
XBP1P17861 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms