Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARHGEF9O43307 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms