Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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COL5A1-AS1Q5SY13 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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COL5A1-AS1Q5SY13 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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COL5A1-AS1Q5SY13 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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