Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LAMB3Q13751 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMB3Q13751 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms