Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD8B2A6NJW9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8B2A6NJW9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD8B2A6NJW9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms