Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJB2P29033 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJB2P29033 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJB2P29033 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJB2P29033 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GJB2P29033 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GJB2P29033 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GJB2P29033 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJB2P29033 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJB2P29033 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GJB2P29033 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms