Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms