Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU4F1Q01851 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POU4F1Q01851 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms