Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKL1Q00532 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms