Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL3P10147 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL3P10147 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3P10147 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3P10147 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3P10147 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3P10147 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3P10147 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3P10147 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL3P10147 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL3P10147 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms